Institut de Biologie des Plantes - UMR 8618

Partenaires

Menu

• Organisation
• Equipes de Recherche
  • Métabolisme
    • Signalisation et régulation métabolique
    • Signalisation redox
    • Oxidative and Metabolic Signaling
  • Génome et Développement
    • Chromatine et développement des plantes
    • Réparation/recombinaison de l’ADN chez Arabidopsis thaliana
    • Cycle Cellulaire et développement - Cell Cycle and Development
  • Interaction Plantes/ Microorganismes
    • Evolution des gènes de résistance aux maladies chez le haricot commun
    • Glycosyltransférases du métabolisme secondaire
• Plateforme Métabolisme-Métabolome
• Plateau technique
  • La Serre et les salles de culture
  • Le M.E.B à Imagif
  • Cytologie et Imagerie
    • Laboratoire Cytologie
    • Plateau Microscopie - Imagerie
    • Contact et Accès
    • Galerie photos et publications du service
  • Bioinformatique
  • Informatique
  • Technique et Logistique
• Publications
• Emplois Docteurs - Information - Offres Allocations de thèse
• Amphithéatre
• Ecole doctorale
• Enseignement
• Accès
• Liens utiles

• Annuaire

• Intranet

Rechercher

Composition du groupe

• Sophie Blanchet ((IE Université)
• Valérie Geffroy (Chercheur INRA)
• Stéphanie Pflieger (Enseignant-chercheur Paris 7)
• Manon Richard (Doctorante)

Thématique de l’équipe

Nos travaux de recherche portent sur la génomique comparative de clusters de gènes de résistance chez les plantes, plus spécifiquement chez le haricot commun, Phaseolus vulgaris. L’interaction Phaseolus vulgaris/Colletotrichum lindemuthianum est particulièrement adaptée à l’étude de l’évolution des gènes de résistance car : (i) la diversité des formes sauvages et cultivées de P. vulgaris est bien caractérisée, (ii) de nombreux gènes de résistance spécifiques ont été identifiés chez Phaseolus vulgaris, et enfin (iii) un phénomène de co-évolution entre la plante et le pathogène a été identifié à l’échelle des centres de diversité de P. vulgaris. Dans ce cadre, nous nous intéressons plus particulièrement à l’étude de 2 locus complexes de résistance, le locus B4 et le locus Co-2. Ces 2 locus comprennent de nombreuses séquences de type NBS-LRR (Nucleotide binding site-Leucine rich repeat), classe prépondérante des gènes de résistance identifiés chez les plantes. Le séquençage de ces 2 locus est en cours. Les comparaisons de séquences entre les 2 pools géniques du haricot commun et avec la séquence correspondante issue de différentes légumineuses, telles que le soja (collaboration avec R.W. Innes, USA), Medicago truncatula ou Lotus japonicus permettra d’étudier l’évolution des clusters de gènes de résistance sur une échelle de temps courte ou longue.

Liens :

Visitez le site Web de nos collaborateurs :

• Genoscope,
• NSF-funded

Publications :

• David P, colas des Francs-Small C, Sévignac M, Thareau V, Macadre C, Langin T, Geffroy V. 2010. Three highly similar formate dehydrogenase genes located in a cluster of NBS-LRR are differentially expressed under biotic and abiotic stresses in Phaseolus vulgaris. Theoretical and Applied Genetics. (sous presse)

• Fonsêca A, Ferreira J, Ribeiro Barros dos Santos T, Mosiolek M, Bellucci E, Kami J, Gepts P, Geffroy V, Schweizer D, Galvão Bezerra dos Santos K, Pedrosa-Harand A. 2010. Cytogenetic map of common bean (Phaseolus vulgaris L.). Chromosome Research. (sous presse)

• David P, Chen NWG, Pedrosa-Harand A, Thareau V, Sévignac M, Cannon SB, Debouck D, Langin T, Geffroy V. 2009. A nomadic subtelomeric disease resistance gene cluster in common bean. Plant physiology. 151, 1048-1065.

• A. Pedrosa-Harand, J. Kami, P. Gepts, V. Geffroy, D. Schweizer. 2009. Cytogenetic mapping of common bean chromosomes reveals a less compartmentalized small-genome plant species. Chromosome Research. 17 : 405-417.

• V. Geffroy, C. Macadré, P. David, A. Pedrosa-Harand, M. Sévignac, C. Dauga, T. Langin. 2009. Molecular analysis of a large subtelomeric NBS-LRR family in two representative genotypes of the major gene pools of Phaseolus vulgaris. Genetics. 181 : 405-419.

• A. Wawrzynski, T. Ashfield, N.W.G. Chen, J. Mammadov, A. Nguyen, R. Podicheti, S.B. Cannon, V. Thareau, C. Ameline-Torregrosa, E. Cannon, B. Chacko, A. Couloux, A. Dalwani, R. Denny, S. Deshpande, A.N. Egan, N. Glover, S. Howell, D. Ilut, H. Lai, S. Martin del Campo, M. Metcalf, M. O’Bleness, B.E. Pfeil, M.B. Ratnaparkhe, S. Samain, I. Sanders, B. Ségurens, M. Sévignac, S. Sherman-Broyles, D.M. Tucker, J. Yi, J.J. Doyle, V. Geffroy, B.A. Roe, M.A. Saghai Maroof, N.D. Young, R.W. Innes. 2008. Replication of non-autonomous retroelements in soybean appears to be both recent and common. Plant physiology. 148 : 1760-1771.

• R.W. Innes, C. Ameline-Torregrosa, T. Ashfield, E. Cannon, S.B. Cannon, B. Chacko, N.W.G. Chen, A. Couloux, A. Dalwani, R. Denny, S. Deshpande, A.N. Egan, N. Glover, C.S. Hans, S. Howell, D. Ilut, S. Jackson, H. Lai, J. Mammadov, S. Martin delCampo, M. Metcalf, A. Nguyen, M. O’Bleness, B.E. Pfeil, R. Podicheti, M.B. Ratnaparkhe, S. Samain, I. Sanders, B. Ségurens, M. Sévignac, S. Sherman-Broyles, V. Thareau, D.M. Tucker, J. Walling, A. Wawrzynski, J. Yi, J.J. Doyle, V. Geffroy, B.A. Roe, M.A. Saghai Maroof, N.D. Young. 2008. Differential accumulation of retroelements and diversification of NB-LRR disease resistance genes in duplicated regions following polyploidy in the ancestor of soybean. Plant physiology. 148 : 1740-1759.

• P. David, M. Sévignac, V. Thareau, Y. Catillon, J Kami, P. Gepts, T. Langin and V. Geffroy. 2008. BAC end sequences corresponding to the B4 resistance gene cluster in common bean : a resource for markers and synteny analyses. Molecular Genetics and Genomics. 280 : 521-533.

• V. Geffroy, M. Sévignac, P. Billant, M. Dron and T. Langin. 2008. Resistance to Colletotrichum lindemuthianum in Phaseolus vulgaris - A case study for mapping two independent genes. Theoretical and Applied Genetics. 116:407-415.

• M.A. Hannah, K.M. Krämer, V. Geffroy, J. Kopka, M.W. Blair, A. Erban, C.E. Vallejos, A.G. Heyer, F. E.T. Sanders, P.A. Millner, D.J. Pilbeam. 2007. Hybrid weakness controlled by the DL gene system in common bean (Phaseolus vulgaris L.) is caused by a shoot-derived inhibitory signal leading to programmed root death. New Phytologist. 176 : 537-549.

• J. Kami, V. Poncet, V. Geffroy and P. Gepts. 2006. Development of phylogenetically-related BAC libraries and sequence of the APA locus in Phaseolus vulgaris. Theoretical and Applied Genetics. 112 (6) : 987-998.

• E. Ferrier-Cana, , C. Macadré, M. Sevignac, Perrine David, T. Langin and V. Geffroy. 2005. "Distinct post-transcriptional modifications result into seven alternative transcripts of the CC-NBS-LRR gene JA1tr of Phaseolus vulgaris". Theoretical and Applied Genetics. 110:895-905.

• E. Ferrier-Cana, V. Geffroy, C. Macadré, F. Creusot, P. Imbert-Bolloré, M. Sévignac, and T. Langin. 2003. Characterization of expressed NBS-LRR resistance genes candidates from common bean. Theoretical and Applied Genetics. 106:251-261.